13.02 - 14:45

Новые данные помогли описать взаимосвязь между вирусами и раком


 

В рамках глобального проекта Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes (PCAWG) исследователи еще раз подтвердили, что вирусы являются одними из ключевых драйверов некоторых типов рака. Они описали известные и новые ассоциации вирусов с онкогенными мутациями, их подписями в геноме, профилями активности генов и выживаемостью пациентов. Работа опубликована в журнале Nature Genetics.

На днях завершился амбициозный проект PCAWG, — результат коллаборации двух основных платформ для исследования генетики рака (TCGA и ICGC) и интернациональной группы приглашенных ученых. Целью проекта было сравнить основные типы рака в разных тканях. Для этого были сделаны пары полных геномов для здоровой и опухолевой ткани 2658 раковых пациентов, а для 1222 из них отсеквенировали еще и транскриптомы. Обработка такого большого количества новых данных вместе с дополнительными исследованиями позволили упорядочить уже имеющиеся знания и узнать много нового: по результатам проекта вышла 21 статья в ведущих научных журналах (все статьи находятся в открытом доступе).


Количество пациентов с опухолями в разных тканях

В частности, отдельная группа ученых проверила на свежих данных вклад вирусов в развитие опухолей. Вирусы папилломы человека, Эпштейна — Барр и гепатитов В и С давно считаются драйверами отдельных видов рака. Тем не менее, большинство работ посвящено отдельным типам рака или вирусов и сравнивать их результаты не всегда возможно. В новой же работе Петер Лихтер (Peter Lichter) и его коллеги провели глобальный скрининг, позволивший подтвердить или опровергнуть уже имеющиеся гипотезы, а также выяснить новые детали вирусно-раковых взаимоотношений.
Первым делом исследователи нашли зараженные вирусами образцы. Чтобы это сделать, они убрали из данных секвенирования все последовательности, которые были похожи на человеческие, а затем, используя три разных методики, сравнили оставшиеся с геномами известных вирусов. Те последовательности, которые были мало или слишком похожи на ДНК используемых в биоинженерии вирусов, также исключили, но и после этой фильтрации следы вирусов нашлись в 16 процентах всех образцов.


Количество пациентов у которых в опухолевых (сверху) или здоровых тканях обнаружили те или иные вирусы

Главные три из 24 найденных вирусов — альфа папилломавирус, вирусы Эпштейна — Барр и гепатита В — хорошо известны своей онкогенностью. В основном они были локализованы в больных тканях: папилломавирус в раках шейки матки, головы и шеи (HNSCC), вирус Эпштейна — Барр обнаружили в желудке и пищеводе, а вирус гепатита В — в печени.
Предположительно, механизмы, которые запускают «вирусный» рак и обычный, отличаются, и в новой работе этому нашлось подтверждение. Сравнив количество типичных драйверных мутаций (например в гене P53) исследователи выяснили, что у пациентов с вирусами папилломы и гепатита В их значительно меньше чем в раках того же типа без вирусов. По-видимому, вирусные онкогены и так достаточно влияют на клетки, и для их превращения в раковые появление внутренних поломок избыточно. Так, для вируса гепатита В выяснилось, что его ДНК очень любит встраиваться в человеческий геном посередине гена TERT, активность которого определяет способность клетки делиться. Интеграция вируса не ломала этот ген, а наоборот усиливала его работу.

Другой вирус, MMTV, потенциально связанный с раком груди, нашелся лишь в одном образце, — и это был образец почечной карциномы, так что гипотеза не получила подтверждения.

Для остальных вирусов их связь с раком оказалась не столь очевидна. Так, вирус герпеса шестого типа нашли у многих пациентов с раком поджелудочной, желудка и кишечника, но внутри одного пациента он в полтора раза чаще обнаруживался в здоровой ткани, чем в опухолевой. Механизм работы вируса в этом случае пока неясен.

О том, что некоторые вирусы могут спровоцировать рак, известно с начала двадцатого века, но механизм их работы до сих пор вызывает вопросы. Часто онкогенные вирусы ведут себя очень тихо и незаметно, а между заражением и развитием рака — если оно вообще начнется — могут пройти годы. О том, что известно про онковирусы на текущий момент и как с ними можно бороться можно почитать в нашем материале.

Вера Мухина

https://nplus1.ru/

Ключевые слова:
Читайте также:

5 продуктов, которые защищают головной мозг от возрастной деградации

С возрастом когнитивные функции мозга ослабевают, что повышает риск его деградации и ассоциированных болезней – Альцгеймера, Паркинсона и т.д.
Подробнее »»

6 секретных приемов, чтобы выйти из бани красавицей

Любительницы бань и саун, возьмите на вооружение наши лайфхаки.
Подробнее »»

Эксперт рассказала о плюсах и минусах мультивитаминов

Нутрициолог рассказала, почему не стоит всем подряд принимать витаминные комплексы
Подробнее »»

Пророщенные грецкие орехи: эликсир молодости и защита от болезней

Если употреблять ядра в таком виде, их польза увеличится стократно.
Подробнее »»

Диетолог рассказала, сколько хлеба можно съесть без вреда для фигуры

Употребление хлеба во время похудения — это вопрос, беспокоящий многих желающих обрести фигуру мечты.
Подробнее »»

Читайте также:
20.02 - 06:37

«Коварство» автокресел: как правильно перевозить ребенка зимой

Опасность связана с теплой одеждой.
Подробнее »»

20.02 - 06:13

Насколько опасно пить известковую водопроводную воду?

Известковая водопроводная вода оставляет характерный налет в чайниках и стиральных машинах, поэтому пить ее многие боятся, считая опасной.
Подробнее »»

20.02 - 05:33

Секрет виниров: что нужно учесть перед установкой

Микропротезы из керамики кардинально меняют внешность людей. Улыбка становится поистине голливудской. Кому подходят виниры и сколько длится их эффект, нам рассказали специалисты стоматологической клиники «Дента Лайн».
Подробнее »»

20.02 - 05:11

Как всего за несколько дней избавиться от лишнего и прийти в форму: советы диетолога

Диетолог также поделилась меню на несколько дней
Подробнее »»

20.02 - 04:32

10 съедобных цветков, которые подходят для украшения еды

Прежде чем съесть цветок из тарелки, убедитесь, что он не токсичный.
Подробнее »»

20.02 - 04:08

5 преимуществ коксового масла

Преимущества кокосового масла варьируется от содействия в снижении веса до повышения здоровья сердца.
Подробнее »»

19.02 - 23:29

Жизнь рядом с зелеными насаждениями может задержать у женщин наступление менопаузы

Жизнь в более зеленом районе может задерживать начало менопаузы у женщин, - об этом свидетельствуют данные исследования, опубликованного в журнале Environment International.
Подробнее »»

19.02 - 23:02

Назван способ снизить давление за 15 минут

Он действительно работает.
Подробнее »»

19.02 - 22:00

Назван способ быстро снять стресс

Существуют простые и эффективные способы справиться со стрессом.
Подробнее »»

19.02 - 21:56

Эти продукты не стоит есть после 30 лет

Это не лучший выбор.
Подробнее »»

19.02 - 21:46

Какие женские лица мужчины считают наиболее привлекательными 

Наука стремится изучить и объяснить все явления. В результате даже у такого сложного понятия как красота есть своя формула. Подробности — в статье.
Подробнее »»

19.02 - 21:36

Бесплодию бой: древние и современные рецепты от природы

Действенную помощь могут оказать лекарственные растения.
Подробнее »»

19.02 - 20:53

Эти продукты способствуют сжиганию жира

Диетологи назвали топ-7 лучших продуктов, которые помогут в похудении к лету.
Подробнее »»

19.02 - 20:47

Врач рассказал, на что может указывать храп

Храп может свидетельствовать о серьезных заболеваниях, хотя сам по себе угрозу для организма не представляет, заявил врач-отоларинголог.
Подробнее »»

19.02 - 19:49

Подготовка к родам: пять способов расслабиться

Существует множество способов облегчить процесс родов
Подробнее »»


Загрузка...
Loading...

Справочная информация

Загрузка...