13.02 - 15:48

Анализ генома нового вируса амеб не нашел у него родственников


 

Исследователи из Бразилии описали новый вид ДНК-вирусов, паразитирующих на амебах. Анализ генома вируса показал, что почти все его гены являются уникальными и не похожи ни на гены других вирусов амеб, ни на какие-либо содержащиеся в базах данных последовательности ДНК. Статью, описывающую детальное исследование вируса с загадочным происхождением, авторы предварительно выложили на BioRxiv, кратко о ней рассказывает Science.

Вирусы амеб заинтересовали ученых после открытия у простейших необычных паразитов — гигантских вирусов, которые по размерам не уступают бактериям. Первые из них были названы мимивирусами, и с момента их описания в 2003 году были обнаружены десятки видов гигантских вирусов. Их особенностью является не просто размер частиц, но и очень большой геном, кодирующий сотни генов, в том числе компоненты аппарата синтеза белка, в то время как у многих обычных вирусов количество генов буквально можно пересчитать по пальцам.

Все ранее описанные вирусы амеб объединяет несколько общих черт. В частности, большой геном содержит около 20 общих генов, указывающих на единое происхождение, что позволяет отнести гигантские вирусы к суперсемейству NCLDV (nucleocytoplasmic large DNA viruses — крупные ядерно-цитоплазматические ДНК-содержащие вирусы), куда кроме них входит еще несколько семейств ДНК-вирусов.

В поисках новых видов гигантских вирусов исследователи из Федерального университета Минас-Жерайс (Бразилия) выделяли вирусные частицы из амеб рода Acanthamoeba, собранных в донных отложениях местного озера. Им удалось обнаружить новый, относительно небольшой вирус, который назвали яравирусом в честь божества Яра («мать воды») из мифологии местных индейцев.

Анализ генома вируса размером примерно 45 тысяч пар оснований позволил предсказать наличие 74 генов, из которых только шесть удалось идентифицировать при помощи поиска по гомологии (похожести) в базах данных. По всей видимости, они кодируют «обычные» вирусные ферменты типа ДНК-полимеразы. Остальные 68 генов, то есть более 90 процентов всех генов яравируса, не только оказались не похожи на гены других вирусов амеб, но и вообще ни на какие известные белок-кодирующие последовательности ДНК (такие гены в терминологии биоинформатиков называются орфанными).

Поиск по метагеномным базам данных, то есть базам, содержащим последовательности из совокупности организмов в какой-либо экосистеме, не позволил отнести яравирус к какой-то известной таксономической группе, и исследователи заключили, что это ранее не описанный редкий вирус, неродственный вирусам из суперсемейства, к которому принадлежат другие паразиты простейших. Особенности жизненного цикла яравируса позволили предположить, что Acanthamoeba не является его главным хозяином, и изначально он паразитировал на каком-то другом организме.

Впрочем, по словам вирусологов, комментарии которых приводит Science, орфанный геном — не такая уж большая редкость в мире вирусов, новые виды которых открывают регулярно. Это скорее указание на слабую изученность вирусов и их родственных связей в целом. Ученые оценивают количество существующих видов вирусов в миллионы, в то время как в центральной базе данных GenBank содержится всего 9 тысяч последовательностей вирусных геномов. Так, в свежей работе, опубликованной в журнале eLife, биоинформатики предсказали существование в тканях животных нескольких тысяч кольцевых ДНК вирусов, из которых около 600 оказались обладателями полностью неизвестных генов.
Дарья Спасская

https://nplus1.ru/

Ключевые слова:
Читайте также:

5 продуктов, которые защищают головной мозг от возрастной деградации

С возрастом когнитивные функции мозга ослабевают, что повышает риск его деградации и ассоциированных болезней – Альцгеймера, Паркинсона и т.д.
Подробнее »»

6 секретных приемов, чтобы выйти из бани красавицей

Любительницы бань и саун, возьмите на вооружение наши лайфхаки.
Подробнее »»

Эксперт рассказала о плюсах и минусах мультивитаминов

Нутрициолог рассказала, почему не стоит всем подряд принимать витаминные комплексы
Подробнее »»

Пророщенные грецкие орехи: эликсир молодости и защита от болезней

Если употреблять ядра в таком виде, их польза увеличится стократно.
Подробнее »»

Диетолог рассказала, сколько хлеба можно съесть без вреда для фигуры

Употребление хлеба во время похудения — это вопрос, беспокоящий многих желающих обрести фигуру мечты.
Подробнее »»

Читайте также:
20.02 - 06:37

«Коварство» автокресел: как правильно перевозить ребенка зимой

Опасность связана с теплой одеждой.
Подробнее »»

20.02 - 06:13

Насколько опасно пить известковую водопроводную воду?

Известковая водопроводная вода оставляет характерный налет в чайниках и стиральных машинах, поэтому пить ее многие боятся, считая опасной.
Подробнее »»

20.02 - 05:33

Секрет виниров: что нужно учесть перед установкой

Микропротезы из керамики кардинально меняют внешность людей. Улыбка становится поистине голливудской. Кому подходят виниры и сколько длится их эффект, нам рассказали специалисты стоматологической клиники «Дента Лайн».
Подробнее »»

20.02 - 05:11

Как всего за несколько дней избавиться от лишнего и прийти в форму: советы диетолога

Диетолог также поделилась меню на несколько дней
Подробнее »»

20.02 - 04:32

10 съедобных цветков, которые подходят для украшения еды

Прежде чем съесть цветок из тарелки, убедитесь, что он не токсичный.
Подробнее »»

20.02 - 04:08

5 преимуществ коксового масла

Преимущества кокосового масла варьируется от содействия в снижении веса до повышения здоровья сердца.
Подробнее »»

19.02 - 23:29

Жизнь рядом с зелеными насаждениями может задержать у женщин наступление менопаузы

Жизнь в более зеленом районе может задерживать начало менопаузы у женщин, - об этом свидетельствуют данные исследования, опубликованного в журнале Environment International.
Подробнее »»

19.02 - 23:02

Назван способ снизить давление за 15 минут

Он действительно работает.
Подробнее »»

19.02 - 22:00

Назван способ быстро снять стресс

Существуют простые и эффективные способы справиться со стрессом.
Подробнее »»

19.02 - 21:56

Эти продукты не стоит есть после 30 лет

Это не лучший выбор.
Подробнее »»

19.02 - 21:46

Какие женские лица мужчины считают наиболее привлекательными 

Наука стремится изучить и объяснить все явления. В результате даже у такого сложного понятия как красота есть своя формула. Подробности — в статье.
Подробнее »»

19.02 - 21:36

Бесплодию бой: древние и современные рецепты от природы

Действенную помощь могут оказать лекарственные растения.
Подробнее »»

19.02 - 20:53

Эти продукты способствуют сжиганию жира

Диетологи назвали топ-7 лучших продуктов, которые помогут в похудении к лету.
Подробнее »»

19.02 - 20:47

Врач рассказал, на что может указывать храп

Храп может свидетельствовать о серьезных заболеваниях, хотя сам по себе угрозу для организма не представляет, заявил врач-отоларинголог.
Подробнее »»

19.02 - 19:49

Подготовка к родам: пять способов расслабиться

Существует множество способов облегчить процесс родов
Подробнее »»


Загрузка...
Loading...

Справочная информация

Загрузка...